Работнику надо пересчитать налог с января, а разницу вернуть на основании его письменного заявления (письмо Минфина России от 6 октября 2016 г. № 03-04-05/58149). Неважно, что работник принес уведомление из ИФНС не с начала года.
Пример Как вернуть НДФЛ работнику, который принес уведомление на вычет
Оклад работника – 30 000 руб.
С января по ноябрь ему начислили 330 000 руб. (30 000 руб. х 11 мес.).
С этих доходов бухгалтер удержал и перечислил НДФЛ – 42 900 руб. (330 000 руб. х 13%).
В декабре сотрудник принес уведомление о праве на имущественный вычет в размере 1 млн руб. Значит, работник вправе получить от компании 130 000 руб. (1 000 000 руб. х 13%).
Это больше, чем удержанная сумма (130 000 > 42 900). Значит, работнику надо вернуть все 42 900 руб.
НДФЛ за декабрь – 3900 руб. (30 000 руб. х 13%) – бухгалтер удерживать не будет. Остаток вычета – 39 000 руб. (42 900 – 3900). Его работник может получить в инспекции или перенести вычет на следующий год. Но для этого нужно новое уведомление.